ในการวิเคราะห์กลไกของปฏิกิริยา จะต้องคำนึงถึงปัจจัยทั้งหมดที่มีอิทธิพลต่อวิถีของมัน หลังจากที่องค์ประกอบทางเคมีจำนวนมากได้รับการระบุโดยวิธีปกติของการกำหนดและวิเคราะห์โครงสร้างแล้ว จะต้องตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงของปฏิกิริยาก่อนปฏิกิริยาใดๆ ที่เกี่ยวข้องกับสารตั้งต้น ไม่ว่าจะเป็นทีละรายการหรือร่วมกัน ดังนั้น ในการแยกสารเอทิลอะซีเตตด้วยน้ำ (การไฮโดรไลซิส) รีเอเจนต์จริงที่โจมตีโมเลกุลเอทิลอะซิเตตอาจเป็นโมเลกุลของน้ำเอง หรืออาจเป็นไฮดรอกไซด์ไอออน (OH―) ปฏิกิริยา ที่ผลิตจากมันซึ่งโครงสร้างของโมเลกุลจะแสดงเป็นแผนผังด้วยสูตรโครงสร้าง ลูกศรใช้เพื่อระบุปฏิกิริยา โดยมีสูตรสำหรับสารตั้งต้นทางด้านซ้ายและผลิตภัณฑ์ทางด้านขวา ในสูตรโครงสร้าง อะตอมของธาตุจะแสดงด้วยสัญลักษณ์ทางเคมี (C สำหรับคาร์บอน H สำหรับไฮโดรเจน และ O สำหรับออกซิเจน) และจำนวนของอะตอมในกลุ่มใดกลุ่มหนึ่งถูกกำหนดโดยตัวห้อยที่เป็นตัวเลข พันธะเคมีที่น่าสนใจที่สุดแสดงด้วยเส้นสั้นๆ ระหว่างสัญลักษณ์ของอะตอมที่เชื่อมกันด้วยพันธะ